セリン/アスパラギン酸ラセマ ... - d-amino-acid.jp

1 2017 D- D- Vo l .5, No. 1, 6-14 (2017) 6 Award Accounts 5 D- / . D- 1) D-Ser N- -D- NMDA 1; 2) D-Asp NMDA 3-5) D-Asp 1) D-Asp NMDA D-Asp NMDA 6; 7) D-Ser D-Asp D-Ala 8) D-Arg D- D-Arg AT P 9) D- D- D.

2 AlaR Ser AspR D-Amino acid racemase 1 DAR1 10-15) AlaR PLP AlaR SerR PLP SerR AlaR PLP / SerR Ser 2017 D- D- Vo l .5, No. 1, 6-14 (2017) 7 L-Ser D-Ser 12; 15) SerR 16-22) 1 AspR PLP AspR PLP SerR 43% AspR Ser Asp DAR1 AspR 55% Ser Asp 11) SerR AspR DAR1 SerR BLAST SerR SerR cDNA RT-PCR cDNA 11 SerR SerR 23).

3 SerR AspR / SerR SerR AspR SerR 2 A B 1 A AspR DAR1 B SerR AspR SerR 22 SerR Ser Asp Ser SerR Asp AspR A B SerR AspR SerR AspR SerR AspR SerR AspR / Roseobacterlitoralis Pyrobaculumislandicum 151 152150-152 PPYPSSSSSSASPPYSSSPPYPPYPSSHPYHPFSSSHPFH PYEPYPPYPSSPPFSASSSSHSSSPSHSSHSNHPNHPNSS HSPVHPFHPFHPYPPYHPYHPYHPFHAYPPFDAR1 AspRAspRLAspRL1 AspRL2 AB 1 SerR AspR 150-152 2017 D- D- Vo l.

4 5, No. 1, 6-14 (2017) 8 1 SerR AspR 150-152 Kmkcatkcat/Km[mM][10-3 s-1][10-3 s-1 mM-1] SerRHPYL-Ser to D-Ser23) (Milnesium tardigradum)D-Ser to L-Ser23) SerRHPYL-Ser to D-Ser23) (Dugesia japonica)D-Ser to L-Ser23) to D-Asp23) to L-Asp23) (Caenorhabditis elegan) to Pyruvate24) AspRSSSL-Asp to D-Asp23) ,000 2,0002,230 170(Penaeus monodon)D-Asp to L-Asp23) ,600 1,0002,810 60L-Ser to D-Ser23) to L-Ser23) to D-Ser23)146 to L-Ser23)119 to Pyruvate* AspRSSSL-Asp to D-Asp23) ,650 8501,820 60(Crassostrea gigas)D-Asp to L-Asp23) ,100 7002,120 110L-Ser to D-Ser23) to L-Ser23)196 23252 to D-Ser* to L-Ser* to Pyruvate* AspRPSSL-Asp to D-Asp23) ,700 2,60018,700 1,200(Acropora millepora)D-Asp to L-Asp23) ,300 1,80018,400 600L-Ser to D-Ser23) to L-Ser23) to Pyruvate* to D-Ser23) to L-Ser23) AspRSPSL-Asp to D-Asp23) (Strongylocentrotus purpuratu)D-Asp to L-Asp23) SerRHPNL-Ser to D-Ser23) (Mus musculus)D-Ser to L-Ser23) to D-Asp23) to L-Asp23) to Pyruvate* to Pyruvate* SerRHPNL-Ser to D-Ser12) (Rattus norvegicus)D-Ser to L-Ser12) SerRHPNL-Ser to D-Ser15) 25166 (Homo sapiens)D-Ser to L-Ser15) ,415 70131 15L-Ser to Pyruvate15)

5 ,660 90353 45D-Ser to Pyruvate15) DAR1 PPYL-Asp to D-Asp11)8 (Aplysia californica)D-Asp to L-Asp11)94 to D-Ser11)15 4107 to L-Ser11)16 2146 AspRSSSL-Asp to D-Asp30) , (Scapharca broughtonii)D-Asp to L-Asp30)159 2714, SerRHPYL-Ser to D-Ser* ,370 (Tetrahymena thermophila)D-Ser to L-Ser* ,010 to Pyruvate* ,940 to Pyruvate* SerRHPFL-Ser to D-Ser20) ,460 (Dictyostelium discoideum)D-Ser to L-Ser20) ,160 8034L-Ser to Pyruvate19) to Pyruvate19) SerRHPFL-Ser to D-Ser18) (Oryza sativa)D-Ser to L-Ser18) to Pyruvate18) to Pyruvate18) SerRHPYL-Ser to D-Ser17) (Arabidopsis thaliana)D-Ser to L-Ser17) to Pyruvate17) to Pyruvate17) SerRHPFL-Ser to D-Ser16) (Hordeum vulgare)D-Ser to L-Ser16) to Pyruvate16) to Pyruvate16) SerRPPYL-Ser to D-Ser22) (Schizosaccharomyces pombe)D-Ser to L-Ser22) to Pyruvate22)3651014D-Ser to Pyruvate22) SerRHAYL-Ser to D-Ser21)18514,80080(Pyrobaculum islandicum)D-Ser to L-Ser21) , to Pyruvate21) ,00028,200- SerRHPYL-Ser to D-Ser29) ,040 (Roseobacter litoralis)D-Ser to L-Ser29) ,220 to Pyruvate29) to Pyruvate29) * : Keq : (kcat/Km for L-isomer)/(kcat/Km for D-isomer).

6 Keq150-152 2017 D- D- Vo l .5, No. 1, 6-14 (2017) 9 . / AspR SerR Km AspR SerR 2 kcat SerR 1 SerR 200 1 L- -3- 24) SerR SerR Asp SerR SerR Ser kcat/Km 3 Asp 1 SerR Asp 12) SerR 23) SerR D-Asp 25) SerR PC12 D-Asp 26) SerR D-Asp AspR AspR Asp Glu / Asp/GluR AspR Asp Asn / Asp/AsnR / SerR AspR GluR AsnR L- -3.

7 SerR AspR SerR AspR Asp/GluR Asp/AsnR / SerR AspR SerR Asp SerR AspR SerR AspR SerR 27) L-Ser Ser82 Arg133 Gly236 Gln238 SerR AspR AspR 150-152 2 3 Ser SerR 150-152 Ser 150-152 SerR 150 His Pro 151 Pro 1 SerR AspR 150-152 150-152 SerR 27) L-Ser 2 AspR Triple serine loop 23) 2017 D- D- Vo l .5, No. 1, 6-14 (2017) 10 150-152 SerR AspR AspR Triple serine loop Ser SerR H150-P151-N152 SerR Triple serine loop SerR AspR 151 152 2 Ser SerR AspR 150-152 AspR kcat 57 s-1 AspR kcat s-1 1 AspR 150-152 S150-P151-S152 Asp Ser151 DAR1 Ser Asp DAR1 DAR1 D-Asp DAR1 D-Asp 11)

8 DAR1 kcat/Km Ser Asp 2 10 AspR SerR 1 DAR1 150-152 P150-P151-Y152 Ser Triple serine loop Asp SerR SerR 150-152 P150-S151-S52 AspR 23) 1 SerR DAR1 500 AspR DAR1 AspR DAR1 DAR1 AspR D-Asp DAR1 AspR . / SerR AspR 151 152 Ser SerR AspR SerR SerRL SerR 13 151 152 Ser 2 SerR 150-152 Tyr152 Pro151 Pro150 Arg133 Ser82 Gly236 Gln238L-Ser 2017 D- D- Vo l.

9 5, No. 1, 6-14 (2017) 11 Triple serine loop SerRL AspR 23) AspR SerR AspR DAR1 AspR RNA-seq NCBI accession no. SRX1959731 AspR BLAST AspRL1 AspRL2 2 1 AspRL2 150-152 P150-P151-Y152 SerR AspRL1 150-152 S150-A151-S152 Asp/GluR 1 AspRL2 AspRL1 D-Asp D-Asn D-Arg 28) AspRL1 AspR SerR SerR A SerR B 3 SerR AspR B SerR 1 SerR 1 2 SerR A B B A GenBank SerR / A SerR SerR B SerR A B.

10 / SerR 16-20; 22) Roseobacter litoralis SerR SerR 3 2017 D- D- Vo l .5, No. 1, 6-14 (2017) 12 29) SerR SerR AspR 1 SerR 150-152 Asp 1 1 SerR AspR EST SRA BLAST 100 SerR 150-152 150-152 Ser Triple serine loop SerR SerR AspR Triple serine loop SerR AspR / SerR 150-152 Triple serine loop SerR AspR 7.