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Parte III - ANAEROBIOS - aam.org.ar

1 Parte III MICROORGANISMOS ANAEROBIOS Editor responsable SILVIA C. PREDARI Jefa del Departamento de Microbiolog a del Instituto de Investigaciones M dicas Alfredo Lanari, Universidad de Buenos Aires. Ciudad Aut noma de Buenos Aires, Argentina. Coordinadora del Comit de Emergencias Biol gicas de la Universidad de Buenos Aires. Ciudad Aut noma de Buenos Aires, Argentina. Miembro del Comit Cient fico Asesor de la Revista Argentina de Microbiolog a, publicaci n cient fica oficial de la Asociaci n Argentina de Microbiolog a. Ciudad Aut noma de Buenos Aires, Argentina. Miembro de la Subcomisi n de Bacterias Anaerobias -Sociedad Argentina de Bacteriolog a, Micolog a y Parasitolog a Cl nicas (SADEBAC)- Asociaci n Argentina de Microbiolog a (AAM).

4 IIId. BACILOS GRAM POSITIVOS ANAEROBIOS NO ESPORULADOS 149 Autores: Liliana Castello y Silvia C. Predari Aspectos taxonómicos 150 Hábitat 155

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1 1 Parte III MICROORGANISMOS ANAEROBIOS Editor responsable SILVIA C. PREDARI Jefa del Departamento de Microbiolog a del Instituto de Investigaciones M dicas Alfredo Lanari, Universidad de Buenos Aires. Ciudad Aut noma de Buenos Aires, Argentina. Coordinadora del Comit de Emergencias Biol gicas de la Universidad de Buenos Aires. Ciudad Aut noma de Buenos Aires, Argentina. Miembro del Comit Cient fico Asesor de la Revista Argentina de Microbiolog a, publicaci n cient fica oficial de la Asociaci n Argentina de Microbiolog a. Ciudad Aut noma de Buenos Aires, Argentina. Miembro de la Subcomisi n de Bacterias Anaerobias -Sociedad Argentina de Bacteriolog a, Micolog a y Parasitolog a Cl nicas (SADEBAC)- Asociaci n Argentina de Microbiolog a (AAM).

2 Ciudad Aut noma de Buenos Aires, Argentina. 2 ndice Cap tulo T tulo P g Parte III MICROORGANISMOS ANAEROBIOS 1 Editor responsable: Silvia C. Predari ndice 2 IIIa. CULTIVO E IDENTIFICACI N DE MICROORGANISMOS ANAEROBIOS 6 Autores: Mar a Adelaida Rossetti y Hebe M. Bianchini Introducci n 7 Aspectos taxon micos H bitat Aspectos patog nicos Factores del hospedero 7 8 8 10 Factores de virulencia del microorganismo Impacto cl nico Diagn stico microbiol gico Recolecci n de la muestra Transporte y conservaci n de la muestra Procesamiento inicial - Figura 1 M todos diagn sticos Culturales y fenot picos Miniaturizados, automatizados y moleculares Fallas en el procesamiento y aislamiento de ANAEROBIOS Bibliograf a Tablas 1, 3.

3 4 y 5 Figuras 2 a 5 Nomenclatura de las bacterias anaerobias aisladas con mayor frecuencia de muestras cl nicas - Tabla 2 10 11 13 13 14 14 15 15 20 22 24 28 32 36 IIIb. COCOS ANAEROBIOS 42 Cocos ANAEROBIOS gram positivos y gram negativos Autores: Mirta R. Litterio B rki y Mar a Raquel Rollet Introducci n 43 Aspectos taxon micos 43 H bitat 44 3 Factores de virulencia 45 Impacto cl nico 48 Diagn stico microbiol gico Identificaci n a nivel de g nero y especie 50 50 Morfolog a microsc pica 50 Caracter sticas culturales 51 Pruebas bioqu micas 53 M todos automatizados, miniaturizados y moleculares 54 Sensibilidad a los antimicrobianos 55 Bibliograf a 58 Tablas 1 a 4 64 Figuras 1 a 5 72 IIIc BACILOS gram POSITIVOS ANAEROBIOS ESPORULADOS 77 Autores.

4 Mar a Raquel Rollet, Mar a Cristina Legaria y Graciela Carloni G nero Clostridium 78 Aspectos taxon micos 78 H bitat 78 Factores de virulencia 79 Gen tica 88 Impacto cl nico 90 Diagn stico microbiol gico 98 Morfolog a microsc pica 100 Caracter sticas metab licas y culturales 101 Cultivo 102 Identificaci n bioqu mica e inmunol gica 104 M todos automatizados, miniaturizados y moleculares 107 Cromatograf a 108 Inmunofluorescencia directa 109 Determinaci n de toxinas y toxinotipos 109 Identificaci n molecular 110 Diagn stico de la infecci n por Clostridium difficile 111 M todo de citotoxicidad y neutralizaci n en cultivos celulares 112 Enzimoinmunoan lisis 112 Glutamato deshidrogenasa 114 Cultivo 115 Cultivo toxig nico 115 M todos moleculares 116 Algoritmos 118 Sensibilidad a los antimicrobianos 118 Bibliograf a 121 Tablas 1 a 6 133 Figuras 1 a 7 142 4 IIId.

5 BACILOS gram POSITIVOS ANAEROBIOS NO ESPORULADOS 149 Autores: Liliana Castello y Silvia C. Predari Aspectos taxon micos 150 H bitat 155 Factores de virulencia 156 Impacto cl nico 159 Actinomyces y organismos relacionados 159 Mobiluncus 161 Propionibacterium 162 Atopobium y Olsenella 164 Eubacterium y organismos relacionados 165 Eggerthella y organismos relacionados 166 Lactobacillus Bifidobacterium y organismos relacionados Identificaci n a nivel de g nero y especie 167 169 169 Consideraciones pr cticas en la identificaci n fenot pica 173 Cromatograf a gas l quido 175 Sistemas miniaturizados, automatizados y moleculares 176 Sensibilidad a los antimicrobianos 181 Bibliograf a 185 Tablas 1 a 7 204 IIIe.

6 BACILOS gram NEGATIVOS ANAEROBIOS 212 Autores: Ana Di Martino, Liliana Fern ndez Canigia,Laura Gliosca y Mar a Cristina Legaria Aspectos taxon micos 213 H bitat 218 Factores de virulencia 220 Impacto cl nico 224 Infecciones asociadas a los g neros: Bacteroides, Parabacteroides, Alistipes y Odoribacter 225 Porphyromonas y Tannerella 227 Prevotella 228 Fusobacterium y otras bacterias fusiformes 230 Infecciones asociadas a otros bacilos gram negativos 232 Identificaci n a nivel de g nero y especie 234 5 M todos moleculares de identificaci n 244 Sensibilidad a los antimicrobianos 246 Bibliograf a 250 Tablas 1 a 9 273 Ap ndice X MEDIOS DE CULTIVO Y REACTIVOS Pruebas bioqu micas manuales: fundamento y m todo 288 Autores: Mar a Adelaida Rossetti y Hebe M.

7 Bianchini Agar bacteroides bilis esculina (ABBE) 288 Agar Brucella o agar infusi n cerebro coraz n (BHI) con antibi tico 288 Agar carne levadura o VL base 288 Agar infusi n cerebro coraz n (BHI) para ANAEROBIOS 289 Agar sangre Brucella 289 Bilis: a) Caldo con bilis 290 b) Discos con bilis 291 Caldo carne levadura 291 Caldo glicerinado al 15 % 291 Caldo infusi n cerebro coraz n (BHI) para anerobios 292 Hemina, soluci n madre 292 Hidr lisis de la esculina: a) Caldo esculina 293 b) M todo de spot 293 Medio base para la fermentaci n de hidratos de carbono 294 Medio para la conservaci n de cepas a temperatura ambiente 295 Polianetol sulfonato de sodio (SPS) 295 Producci n de catalasa 296 Producci n de gelatinasa: a) M todo de los discos de Kohn 297 297 b) M todo de Frazier 298 Producci n de indol: a) En medio l quido 299 b) Prueba de toque 300 Producci n de lecitinasa lipasa: Agar yema de huevo 300 Producci n de ureasa.

8 A) En medio l quido 301 b) En disco 301 Prueba de esporulaci n 302 Reducci n de nitrato 303 Sangre lacada 304 Suplementos para prueba de estimulaci n de crecimiento 304 Vitamina K1, soluci n madre 305 6 Cap tulo IIIa. CULTIVO E IDENTIFICACI N DE MICROORGANISMOS ANAEROBIOS MAR A ADELAIDA ROSSETTI Jefa de la Unidad Microbiolog a del Hospital Interzonal General de Agudos Presidente Per n. Avellaneda, Pcia. de Buenos Aires, Argentina. Coordinadora de la Subcomisi n de Bacterias Anaerobias -Sociedad Argentina de Bacteriolog a, Micolog a y Parasitolog a Cl nicas (SADEBAC)- Asociaci n Argentina de Microbiolog a (AAM).

9 Ciudad Aut noma de Buenos Aires, Argentina. HEBE M. BIANCHINI Asesora del Laboratorio de Bacteriolog a del Centro de Educaci n M dica e Investigaciones Cl nicas Norberto Quirno (CEMIC). Ciudad Aut noma de Buenos Aires, Argentina. Miembro de la Subcomisi n de Bacterias Anaerobias -Sociedad Argentina de Bacteriolog a, Micolog a y Parasitolog a Cl nicas (SADEBAC)- Asociaci n Argentina de Microbiolog a (AAM).Ciudad Aut noma de Buenos Aires, Argentina. 7 Introducci n Desde un punto de vista simplista, pero muy til, se puede definir a las bacterias anaerobias como aquellas que para crecer en la superficie de un medio de cultivo necesitan una atm sfera sin ox geno, ya que este elemento es t xico para ellas.

10 Existe un amplio abanico de microorganismos, desde los muy tolerantes y resistentes hasta los extremadamente l biles a este gas. Seg n el requerimiento de O2 las bacterias se pueden clasificar en aerobios obligados, microaer filos, ANAEROBIOS facultativos, ANAEROBIOS aerotolerantes y ANAEROBIOS obligados (tabla 1). Aspectos taxon micos El conocimiento de la gen tica microbiana ha determinado importantes cambios en la clasificaci n y taxonom a bacteriana que, en el caso de los ANAEROBIOS , han sido muy importantes. Las primeras revisiones de la taxonom a de estas bacterias se realizaron a partir de los a os 70.


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