Partie 1 : Le microbiote intestinal

1 1 UNIVERSITE TOULOUSE III PAUL SABATIER FACULTE DES SCIENCES PHARMACEUTIQUES ANNEE: 2018 THESE 2018/TOU3/2040 TTHHEESSEE POUR LE DIPLOME D'ETAT DE DOCTEUR EN PHARMACIE Pr sent e et soutenue publiquement Par Emilie Doli R le de la flore intestinale dans l immunit : usage actuel des probiotiques et futures indications Le Lundi 9 juillet 2018 Directeur de th se : Mme le Docteur Anne-Dominique TERRISSE Jury : Pr sident : Mr le Professeur G rard CAMPISTRON 1er assesseur : Mme le Docteur Anne-Dominique TERRISSE 2 me assesseur : Mme le Docteur Brigitte MONSARRAT 2 3 4 Remerciements : Je tiens tout particuli rement remercier, Les membres du jury, d avoir accept de juger mon travail : Mr le Professeur Campistron, Mme le Docteur Monsarrat, et en particulier Mme le Docteur Terrisse, pour avoir t ma directrice de th se.

2 Je vous remercie pour le temps que vous m avez accord et pour vos pr cieux conseils. Maman, Papa, Gr ce vous, j ai pu r aliser mes tudes dans les meilleures conditions. Je vous remercie galement pour votre soutien lors de ce travail mais aussi durant toutes ces ann es d tudes. Votre exemple m a aid atteindre mes objectifs. Mes fr res, Nicolas, Quentin, Gaspard et F lix, Pour les moments de d tente partag s ensemble les weekends. Mes grands-parents maternels, Pour votre soutien tout au long de ces ann es ainsi que pour votre accueil lors de mes r visions de la premi re ann e de concours jusqu cette ann e de th se.

3 Aux bons repas de Mamie et aux promenades avec Papi entre deux chapitres. Mes grands-parents paternels, Pour leur bienveillance, leur soutien et les heureux repas partag s en famille. Tous les autres membres de ma famille, Qui m ont soutenue de pr s ou de loin durant ces ann es et pour les bons moments partag s ensemble. Yoann, Je te remercie pour ton aide et ta patience lors de la r daction de cette th se. Mais galement pour tout le soutien et le bonheur que tu m apportes chaque jour.

4 Mes amis, Ana s et cette exp rience inoubliable au Laos, Cindy pour tous ces moments depuis la P1, Estelle pour sa bonne humeur, Gwena l pour nos footings et les repas au RU, Julien pour nos restaurants du vendredi. Merci pour toutes ces ann es et au plaisir de partager les prochaines. 5 Table des mati res : Table des figures : .. 7 Liste des abr viations : .. 9 Introduction : .. 12 Partie 1 : Le microbiote intestinal .. 13 I. Flore intestinale , d finition : ---------------------------------------- ------------------------- 14 A.

5 L pith lium intestinal : ---------------------------------------- --------------------------- 14 B. Analyse : ---------------------------------------- ---------------------------------------- ------ 15 C. Composition : ---------------------------------------- ---------------------------------------- 16 D. Mise en place : ---------------------------------------- --------------------------------------- 18 II. Les fonctions de la flore intestinale : ---------------------------------------- --------------- 21 A.

6 Fonction de barri re et de protection : ---------------------------------------- --------- 21 B. Fonction m tabolique :--------------------------------------- ------------------------------ 22 Le m tabolisme des glucides : .. 22 Le m tabolisme des gaz : .. 22 Le m tabolisme des prot ines : .. 23 Le m tabolisme des lipides : .. 23 C. Fonction immunitaire : ---------------------------------------- ---------------------------- 23 III. Le syst me immunitaire digestif : ---------------------------------------- ------------------ 25 L immunit inn e : ---------------------------------------- ---------------------------------- 25 L immunit adaptative : ---------------------------------------- --------------------------- 27 IV.

7 Interactions h te microbiote dans l intestin : hom ostasie intestinale :---------- 29 V. Variation de la flore au cours du temps : ---------------------------------------- --------- 30 L alimentation : ---------------------------------------- ------------------------------------- 30 L usage de m dicaments tels que les antibiotiques : --------------------------------- 30 Les hospitalisations : ---------------------------------------- ------------------------------- 30 Certaines situations cliniques : ---------------------------------------- ------------------- 30 L ge.

8 ---------------------------------------- ---------------------------------------- --------- 31 Partie 2 : Relation entre microbiote et pathologies .. 32 I. Pathologies gastro-intestinales : ---------------------------------------- --------------------- 33 A. Les maladies inflammatoires chroniques de l intestin : ---------------------------- 33 1. La maladie de Crohn : .. 33 2. La rectocolite h morragique : .. 37 B. Les infections Clostridium difficile : ---------------------------------------- ---------- 40 6 II.

9 Pathologies extra-digestives : ---------------------------------------- ------------------------ 44 A. Surpoids, ob sit et diab te : ---------------------------------------- --------------------- 44 B. Les maladies auto-immunes : ---------------------------------------- --------------------- 56 1. Le lupus ryth mateux diss min : .. 56 2. La polyarthrite rhumato de : .. 60 C. Les troubles du spectre de l autisme : ---------------------------------------- ---------- 69 Partie 3 : Usage actuel des probiotiques et nouvelles strat gies th rapeutiques.

10 74 I. Les probiotiques : ---------------------------------------- -------------------------------------- 75 A. D finition : ---------------------------------------- ---------------------------------------- ---- 75 1. Historique : .. 75 2. D finition actuelle : .. 75 3. M canismes d action : .. 76 4. Effets ind sirables : .. 78 5. Survie des bact ries lactiques dans le tractus digestif : .. 79 B. Usage actuel des probiotiques : ---------------------------------------- ------------------ 81 1. La diarrh e associ e aux antibiotiques.