SINTESI DI PEPTIDI - pianetachimica.it

1 Prof. Mauro Tonellato ITIS Natta Padova SINTESI di PEPTIDI 1 SINTESI DI PEPTIDII ntroduzioneI PEPTIDI possono essere sintetizzati legando tra loro, nella giusta sequenza, gli amminoacidi di cuisono composti. Ci sono due tipi di motivi che possono spingere a sintetizzare un ) Motivi di tipo chimico. Possono riguardare la ricerca e la messa a punto di nuove tecniche disintesi oppure possono riguardare l'indagine sulle complesse relazioni tra struttura e funzione diuna proteina. Per esempio si pu studiare l'effetto provocato sull'attivit biologica di un enzimadalla sostituzione di un amminoacido con un ) Motivi di tipo farmacologico.

2 Possono riguardare la ricerca di nuovi farmaci o la produzione dialtri gi noti. Infatti molti PEPTIDI hanno una forte azione farmacologica, per esempio l'ossitocina, unormone di 9 amminoacidi, stimola la contrazione uterina durante il parto. Le encefaline,pentapeptidi prodotti nell'encefalo, hanno un'azione simile alla morfina. Infine frammenti sintetici diproteine virali sono utilizzati per cercare di produrre nuovi vaccini che sfruttano la SINTESI di PEPTIDI un'operazione molto complessa anche se consiste nel realizzare sempre unsolo tipo di legame, quello ammidico, tra il gruppo carbossilico di un amminoacido e quelloamminico del successivo. Gli amminoacidi infatti sono molecole bifunzionali, alcuni anchetrifunzionali, e quindi non sufficiente realizzare il legame ammidico desiderato, ma necessarioche non si formi nessuno degli altri legami possibili.

3 La SINTESI risulta poi ancora pi difficile per lapresenza di gruppi funzionali nelle catene laterali degli amminoacidi e per la necessit diconservare l'attivit ottica dei carboni chirali in posizione .Gruppi protettoriLa SINTESI di un dipeptide, ad es. alanil-glicina, Ala-Gly, permette di comprendere il problema dellaformazione del legame peptidico. Se si cercasse di ottenere questo dipeptide per sempliceriscaldamento di una miscela dei due amminoacidi, alanina e glicina, si otterrebbe una miscelacomplessa di dipeptidi, tripeptidi e oligopeptidi con sequenze casuali. I soli dipeptidi sarebberoquattro: Ala-Gly, la molecola che si voleva ottenere, e inoltre Gly-Ala, Ala-Ala, sintetizzare correttamente il dipeptide Ala-Gly necessario che siano liberi di reagire solodue gruppi funzionali: il gruppo carbossilico dell'alanina e quello amminico della glicina.

4 Gli altridue gruppi funzionali non devono reagire durante la formazione del legame ammidico e per questodevono essere legati a molecole chiamate gruppi SINTESI del dipeptide Ala-Gly, quindi, pu essere realizzata correttamente solo se alanina eglicina vengono utilizzate protette nella forma X-Ala-OH e H-Gly-OY, dove X e Y rappresentanodue generici protettori rispettivamente del gruppo amminico e di quello carbossilico. Alla fine dellasintesi i gruppi protettori devono poter essere rimossi senza danneggiare il peptide +H-Gly-OYX-Ala-Gly-OY+XNHCHCOOHCH3 XNHCHCCH3 ONHCHHCOOYHNHCHHCOOYX-Ala-Gly-OYH-Ala-Gl y-OYH-Ala-Gly-OH(b)(c)(a)(a)Si forma dapprima, nella reazione (a), il dipeptide X-Ala-Gly-OY completamente protetto.

5 Daquesto si pu ottenere il dipeptide libero Ala-Gly attraverso le due reazioni (b) e (c) di deprotezionedel gruppo amminico e del gruppo SINTESI di un peptide di quattro o pi amminoacidi si pu eseguire secondo due vie alternative:1) per allungamento graduale della catena che consiste nell'incorporare nel peptide unamminoacido alla volta a partire dal terminale Mauro Tonellato ITIS Natta Padova SINTESI di PEPTIDI 22) per condensazione di segmenti che si realizza unendo piccoli PEPTIDI di sequenza appropriataper formare dei segmenti intermedi pi lunghi che vengono poi agganciati tra loro per ottenere lasequenza peptidica qui illustrata la SINTESI per allungamento graduale di un tetrapeptide leucil-fenilalanil-alanil-glicina Leu-Phe-Ala-Gly.

6 Si inizia dalla parte COOH terminale, quindi dalla glicina. Si preparadapprima il dipeptide Ala-Gly a cui successivamente viene unita fenilalanina e per ultima si vede dallo schema seguente, il primo amminoacido, la glicina, viene introdotto con ilgruppo carbossilico protetto nella forma H-Gly-OY, mentre ogni amminoacido successivo vieneintrodotto con il gruppo amminico protetto nella forma (a)(a)(a)(b)(b)(b)(c)= deprotezione del gruppo amminico(b)= deprotezione delgruppo carbossilico(c)(a)nuovo amminoacido= aggancio delLa SINTESI inizia con la preparazione del dipeptide Ala-Gly attraverso la reazione (a) tra X-Ala-OHe H-Gly-OY. Si ottiene il dipeptide completamente protetto X-Ala-Gly-OY.

7 Prima di aggiungere ilterzo amminoacido, Phe, necessario restituire la reattivit al gruppo amminico terminale deldipeptide e quindi bisogna staccare il gruppo protettore X. E' importante che questa operazione (b)avvenga in modo selettivo cio senza staccare anche il protettore Y perch il gruppo carbossilicoterminale del peptide non deve mai reagire per tutto il corso della SINTESI . Si ottiene cos il dipeptideprotetto al carbossile, ma con il gruppo amminico libero H-Ala-Gly-OY. La SINTESI a questo punto siripete sempre uguale, vengono ripetute le stesse reazioni per ogni amminoacido che si vuoleintrodurre. Si esegue prima la reazione (a) di agganciamento (in inglese coupling) con il nuovoamminoacido che deve avere il gruppo amminico protetto e poi la reazione (b) di deprotezioneselettiva del gruppo amminico del peptide.

8 Solo quando si ottenuta la sequenza desiderata siprocede alla deprotezione (c) del gruppo carbossilico che rimasto protetto per tutta la duratadella quanto visto finora si pu dedurre un fatto di validit generale: la stabilit dei legami coinvoltinella SINTESI di PEPTIDI deve appartenere a tre categorie diverse:1) Legami labili: il legame col protettore X del gruppo amminico in posizione .Il protettore X deve essere rimosso prima della reazione di agganciamento del peptide con ciascunamminoacido. Questa operazione si compie tante volte nel corso della SINTESI quanti sono gliamminoacidi che si vogliono agganciare, quindi il protettore X deve poter essere staccato incondizioni blande nelle quali sia stabile il protettore Y del gruppo carbossilico terminale e anche iprotettori di eventuali gruppi in catena ) Legami di media stabilit.

9 Il legame col protettore Y del gruppo carbossilico terminale e con iprotettori dei gruppi in catena Mauro Tonellato ITIS Natta Padova SINTESI di PEPTIDI 3 Questi protettori devono restare legati in modo stabile durante le ripetute operazioni di distacco deiprotettori X del gruppo amminico in , vengono tolti solo alla fine usando condizioni di reazione pi drastiche nelle quali per sia stabile il legame ) Legami stabili: il legame 'obiettivo della SINTESI proprio realizzare i legami ammidici che tengono unito il peptide, quindiquesti legami devono resistere a tutte le condizioni a cui necessario sottoporre il peptide perstaccare i gruppi del legamecol protettore X Stabilit del legamecol protettore Y Stabilit del legameammidico<<<Protezione del gruppo amminicoUno dei pi usati protettori del gruppo amminico in il terzbutil-ossi-carbonile, Boc.

10 E' unprotettore di tipo uretanico che inibisce la reattivit del gruppo amminico trasformandolo in unaammide. La Boc-alanina ha la seguente struttura:terzbutilossicarbonileCH3 CCH3CH3 OCNHOCHCH3 COHOBoc-AlaIl Boc labile in ambiente acido e viene staccato con acido trifluoroacetico, TFA, in diclorometano,DCM, in rapporto 1:1. La sua labilit agli acidi dipende dal fatto che sono presenti due ottimi gruppiuscenti: la CO2, che si sottrae all'equilibrio come gas, e il catione terzbutilico che relativamentestabile in ambiente acido. Questo, in un secondo tempo, pu dare una eliminazione E1 formando2-metilpropene oppure pu dare una sostituzione SN1 con l'acido trifluoroacetico per formareterzbutil trifluoroacetato.