Transcription of INTERPRÉTATION D’UN RÉSULTAT PCR DE COVID-19 …
1 INTERPR tation D UN R SULTAT PCR DE COVID-19 FAIBLEMENT positif 21 Ao t 2020 des clarifications ont t apport es par rapport la version du 30 juillet AVIS RAG Compte tenu de l largissement de la strat gie de testing et du nombre croissant de personnes asymptomatiques test es, par exemple en pr op ratoire ou avant un voyage, un r sultat PCR faiblement positif peut parfois tre difficile interpr ter. L'interpr tation erron e d'un r sultat PCR faiblement positif comme quivalent d infectiosit peut avoir des cons quences importantes sur les diff rents aspects de la vie des patients et de leur foyer, notamment de l'acc s l' ducation pour les enfants, au report d'une op ration chirurgicale, l'utilisation des ressources de sant ou aux cons quences conomiques.
2 Le RAG a labor un avis sur l'interpr tation de ces r sultats . Cet avis a d j t valid par le RMG et est disponible sur le site web de Sciensano : EN PRATIQUE Apr s validation de l avis ci-dessus, plusieurs biologistes cliniques, ayant particip l laboration de l avis RAG initial, ont travaill sur une directive plus concr te pour son application clinique. Quatre crit res ont t tablis, qui doivent tre pris en compte pour valuer si un r sultat peut tre interpr t comme une infection ancienne. Comme directive g n rale, un patient qui remplit les 4 crit res suivants (et ce au moment du pr l vement qui donne un r sultat PCR faiblement positif ) peut, en pratique, tre consid r comme non infectieux: 1.
3 La personne n ayant pas pr sent de sympt mes possibles du COVID depuis minimum une semaine. Si elle a pr sent des sympt mes graves, 4 semaines devront tre respect es depuis le d but d apparition des sympt mes ; 2. la personne n'a eu aucun contact avec un cas positif confirm au cours des 3 derni res semaines (2 semaines d'incubation + 1 semaine de p riode infectieuse) ; 3. le r sultat PCR indique une faible charge d ARN viral (par exemple une valeur Ct lev e, < copies RNA/ml, .. )1 4. il existe un pr c dent r sultat PCR positif pour ce patient, au minimum une semaine avant ce pr l vement, ou une s rologie positive connue.
4 L objectif de ces crit res est d'aider les microbiologistes et les cliniciens interpr ter un r sultat PCR faiblement positif . Elles ne remplacent en aucun cas les indications de testing et les proc dures en vigueur : les personnes qui ont d j t diagnostiqu es par PCR ne devraient g n ralement pas tre retest es end ans les 8 semaines suivantes. 1 Dans la litt rature (voir l'avis RAG initial), aucun virus infectieux n'a t retrouv dans les cultures virales en dessous du seuil d crit ici. Pareil pour les r sultats du CNR : sous ce m me cutoff, aucun virus infectieux n'a t retrouv dans les cultures virales (et ce m me avec une certaine marge).
5 Le cutoff d'une charge virale de copies d'ARN/ml correspond, dans le CNR, une valeur Ct de 32 (ligne de calibration IDT, lors de l'amplification du g ne E, qPCR sarbeco). Cependant, la valeur du Ct correspondant au cutoff quantitatif diff re selon les laboratoires, en fonction de la m thodologie utilis e et du flux de travail (extraction, amplification, calibration). N anmoins, pour tous les laboratoires, on peut dire qu'un r sultat n gatif pour le g ne E peut toujours tre consid r comme une faible charge virale, quel que soit le r sultat pour le g ne N dans ce cas.
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