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CHAPITRE III BIOCHIMIEtES ENZYMESPLAN:PARTIE I :1/ INTRODUCTION ET PROPRIETES DES ENZYMES2/ NOMENCLATURE ET CLASSIFICATION DESENZYMESPARTIE II : CINETIQUE ENZYMATIQUEPARTIE III : REGULATION I : introduction propri t s, nomenclature etclassification des enzymes,OBIECTIFS : connaitre les bases de la nomenclatureofficielle et les 6 classes d'enzyme et leur 'Caract ristique 'exercer crire la r action catalys e lorsqu'onConnait le nom fonctionnel d'une enzyme partird'une r action donn e en suivant les indicationsdonn INTRODUCTION ET PROPRIETES DES ENZYMES :Le but du cours est de donner une vue d'ensemble desenzymes du m les r actions du m tabolisme sont catalys es parles enzymes sont des prot ines qui assurent la catalyse acc l rent les r actions m taboliques d'un organisme y'a au moins une enzyme differente par r astion catalys e, ce quirepr sente des mi[iers d'enzv4es par organisme.]

Created Date: 2/19/2013 7:38:26 PM

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1 CHAPITRE III BIOCHIMIEtES ENZYMESPLAN:PARTIE I :1/ INTRODUCTION ET PROPRIETES DES ENZYMES2/ NOMENCLATURE ET CLASSIFICATION DESENZYMESPARTIE II : CINETIQUE ENZYMATIQUEPARTIE III : REGULATION I : introduction propri t s, nomenclature etclassification des enzymes,OBIECTIFS : connaitre les bases de la nomenclatureofficielle et les 6 classes d'enzyme et leur 'Caract ristique 'exercer crire la r action catalys e lorsqu'onConnait le nom fonctionnel d'une enzyme partird'une r action donn e en suivant les indicationsdonn INTRODUCTION ET PROPRIETES DES ENZYMES :Le but du cours est de donner une vue d'ensemble desenzymes du m les r actions du m tabolisme sont catalys es parles enzymes sont des prot ines qui assurent la catalyse acc l rent les r actions m taboliques d'un organisme y'a au moins une enzyme differente par r astion catalys e, ce quirepr sente des mi[iers d'enzv4es par organisme.]

2 (3000 enzymes)Les enzymes sont r parties sur des organites cellulaires diff rents etpeuvent, ainsi, tre qualifi es de enzymes requi rent obligatoirement pour fonctionner unemol cule annexe ou cofacteur, appel COENZYME. 2 Ces cofacteurs sont de petites mol cules (parfois simple ionm tallique) li e la prot ine enzymes sont les catalyseurs biologiques des r actionsbiochimiques :* catalyseurs :" Ils augmentent les vitesses de n action, sans modifier laconstante d' quilibre, en diminuant l' nergie libred'activation ;" Ils se retrouvent intacts la fin de la r action, bienqu'ils se soient intimement li s au substrat et produits.(R g n r eslo Agissent des concentrations tr s *" ex mpl :L'anhydrase carbonique est une enzyme pr sente dans toutes catalyse lar action d'addition d'une mol cule d'eau sur unemol cule de gaz carbonique pour donner I'acide carbonique qui sedissocie au pH physiologique en un ion bicarbonate et un r action est r versible et aboutit un tat d' quilibre que lacatalyse enzymatique ne change *" ex mple : environ 30g de pepsine pure sont capables dedig rer presque deux tonnes de blanc d' ufs en quelque * Biologiques :o sont produits par la cellule.)

3 Tous les enzymes sont desprot ines de masse mol culaire lev e, thermolabilesm taboliques (excp : les ribozymes sont des ARN dou sd'activit catalytiqueJ ;o Ils sont sp cifiques :ils transforment un substrat donn fsp cificit de substrat) gr ce une r action donn e[sp cificit d'actionJ ;olls sont r gulables :certains enzymes modifient leuractivit catalytique en r ponse des signaux m taboliques,ce qui permet l'ajustement de l'offre m tabolique lademande cellulaire,Toute enzyme est reconnue sur le plan fonctionnel par uner gion sp cifique appel e < site actif> d fini comme tantla r gion ou se fixe{nt) lefsJ substrats et les coenzymes etou a lieu la r action.]}

4 Le site actif joue un double r le : celuide site de fixation du substrat et celui de site site actif est localis au fond d'une poche de la zoneinterne de la prot , f*,fu ' '. -,. ' ,, 1f, ,. -','o '' "t'r, ,,'"', ,i..*,iit J E$gxaill r ..i,'' ,'':.1i;fuii,jrrr / NOMENCTATURE ET CTASSTFTCATTONA/ Classification fonctionnelle : prend encompte le nomdu substrat de l'enzyme et Ie type de r action catalys ,z- -cooHo*"1o"? ) : Pyruvate carboxylCH3-C-COOH +COZll*oPyruvateLorsque l'enzyme utilise 2 substrats on les d signe tousles deux en indiquant : -le substrat donneur de radicauxLe substrat accepteur du radica[lib r Type de r action catalys e plus (aseDEXP : Glutamate pyruvate aminotransf et classification officielle: UI de biochimiea codifi la nomenclature et la classification des enzymesSous une nomenclature dite les enzymes sont r pertori es sous un num roportant 4 nombres s par s par des points et pr c d s deEC IENZYME COMMISSIONJ soit (Ec )Xl.]

5 Peut varier de1 -) rype de r acrionI = oxydor ducr catatysant lesr actions d'oxyd -r duction en transf rant les ions H* et des le sont associ es des coenzymes d'oxydor duction INADFAD, ).JPlusieurs de ces enzymes sont connues en tant que :0xydases,R ductases, nases, ouD shydrog nases2 : transf rases en4vme dont le r le est de catalyser letransfert d'un groupe fonctionnel (par un exemple un groupe thyle ouphosphate) d'une mol (appel e donneur) une autre (appel eaccepteur). Par exemple, une enryme catalysant la r action suivantesera une transferase:A-X + B +A + B-X ouA estle donneur et B I' : hydrolase forment une classe d'enzymes qui catalysentles r actions d'hydrolyse d'esters (est rases : carboxylester-hydrolases;peptidiques(pep tidases : e-aminopeptido-aminoacidohydrolases,pept ido-peptide hydrolases : endopeptidases), et de liaisons osidiques(osidases : glucosidases).

6 Ces enzymes ne n cessitent pasg n ralement de c nzyrnes. Elles sont activables par des , lyase enzyme qui catalyse la rupture de diff rentesliaisons chimiques par des moyens autres que I'hydrolyse ouI'oxydation, formant ainsi souvent une nouvelle liaison double ouun nouveau cycle. Par exemple une enzyme lyase catalyse lar action de transformation de l'ad nosine triphosphate [ATP) enad nosine monophosphate cyclique IAMPc) : ATP + AMPc + PPi5 : isorn rase est une enzyme qui catalyse les changementsau sein d'une mol cule, souvent par r artangement des groupementsfonctionnels et conversion de la mol cule en I'un de ses isom res. Lesisom rases catalysent des r actions du type :A + B o B est un isom ne de AEXP : La phosphoglucomutase est une enzyme de laglycog nosen se qui catalyse la r action :glucose-6-phosphate --+ glucose-1-phosphate, Comme toutes lesmutases, son action ne consiste qu' d placer un groupementphosphate entre deux carbones d'une m me mol : ligaseS : un ligase est une enzyme qui catatyse tajonction de deux mot cutes par de nouvetles liaisonscovste0tes.]

7 Avec hvdrotvse conco!"nitante de ['ATP ou d'autresmot cules nombreuses [igases sont connues sous [e nom de*SynthaS S"rzNZ: signe l'appantenance une sous classe. Ainsi, dans laclasse I, la sous classe indique la nature du donneurd' lectron, dans la clas se Z,la sous classe indique la naturedu groupement transf r . Dans la classe 3, la sous classeindique la nature de la liaison hydrolys e. Dans la classe 4,la sous classe indique la nature de la liaison coup e. Dansla classe 5, la sous classe indique le type d'isom la classe 6, la sous classe indique la nature de laliaison cr : signe l'appartenance une sous-sous dans la classe I et la sous classe I, la sous- sous classeindique la nature de l'accepteur d' : num ro d'ordre dans le groupe et dans le sous groupe'Cette classification officielle pr cise et compl te lanom enclature :la glueose-6-phosphate d shydrog nase catalysela r action glucose 6 phosphate 6-phosphogluconate,R action de la voie des pentoses phosphate, est l'enzymeEC ,1.]]]

8 49 : oxrydor ductase (classeL) dont le donneurd' lectrons est le groupement-C-OH fsous classelJ etI'accepteur d' lectron est le NAD[sous sous classel), denum ro d'ordre biochimie clinique, les enzymes peuvent tre utilis scomme <(param ttre>>, dans deux orientationss miologiques distinctes:'la recherche de d ficit enzymatique g n tiqueEXP : d ficit en G6pD cause d'an mie h molytique."le diagnostic d'organe, par la mesure decertaines activit s enzymatiques le plus : cr atine kinase est un marqueur de cytolyseCardiaque,dans l'infarctus du myocarde.]


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